Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI3P10071 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI3P10071 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms