Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms