Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4AP0C0L4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4AP0C0L4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms