Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms