Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms