Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHBP01229 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHBP01229 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHBP01229 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHBP01229 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms