Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX6O95475 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms