Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFL1O94874 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFL1O94874 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms