Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SURF6O75683 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SURF6O75683 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF6O75683 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF6O75683 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF6O75683 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms