Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3LO60238 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms