Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA2O43464 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms