Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTIFO43310 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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