Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms