Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MEFVO15553 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MEFVO15553 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MEFVO15553 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEFVO15553 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms