Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms