Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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