Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KR12 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KR12 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KR12 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KR12 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms