Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms