Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms