Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HCG22E2RYF7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms