Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms