Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms