Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms