Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms