Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms