Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms