Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA3PQ9Y6N3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA3PQ9Y6N3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms