Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMACHCQ9Y4U1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMACHCQ9Y4U1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMACHCQ9Y4U1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms