Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT52Q9Y366 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT52Q9Y366 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms