Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC2Q9Y2U9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms