Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VDAC3Q9Y277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms