Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX7Q9UNH6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX7Q9UNH6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms