Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP17Q9ULZ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP17Q9ULZ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP17Q9ULZ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms