Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD1Q9UIS9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD1Q9UIS9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD1Q9UIS9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms