Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT1Q9UHJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms