Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA2Q9UBT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA2Q9UBT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms