Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF38Q9NXL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF38Q9NXL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ARHGEF38Q9NXL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms