Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIC8BQ9NVN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIC8BQ9NVN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIC8BQ9NVN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms