Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP3Q9NV31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP3Q9NV31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms