Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM60AQ9NP50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM60AQ9NP50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM60AQ9NP50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM60AQ9NP50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms