Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNDIG1Q9H7V2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNDIG1Q9H7V2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms