Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C12orf49Q9H741 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf49Q9H741 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf49Q9H741 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf49Q9H741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms