Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF41Q9H4P4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF41Q9H4P4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF41Q9H4P4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF41Q9H4P4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF41Q9H4P4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms