Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD1Q9GZZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD1Q9GZZ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms