Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg9Q9DB90 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg9Q9DB90 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg9Q9DB90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms