Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITPNM3Q9BZ71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITPNM3Q9BZ71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITPNM3Q9BZ71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms