Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
KDM5DQ9BY66 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5DQ9BY66 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
KDM5DQ9BY66 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5DQ9BY66 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms