Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM62Q9BVG3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM62Q9BVG3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM62Q9BVG3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM62Q9BVG3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM62Q9BVG3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms