Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCM2Q9BSQ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCM2Q9BSQ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms