Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf66Q96MD2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf66Q96MD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf66Q96MD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms